Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms