Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms