Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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SP6Q3SY56 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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SP6Q3SY56 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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SP6Q3SY56 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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SP6Q3SY56 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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