Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSNAXIP1Q2TAA8 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms