Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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RTL8BQ17RB0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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