Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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LAMA3Q16787 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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LAMA3Q16787 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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LAMA3Q16787 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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