Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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