Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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