Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms