Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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SS18Q15532 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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SS18Q15532 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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SS18Q15532 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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SS18Q15532 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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SS18Q15532 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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SS18Q15532 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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SS18Q15532 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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SS18Q15532 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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