Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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