Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRRQ15256 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms