Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.1 ms