Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms