Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms