Protein–RNA interactions for Protein: Q13686

ALKBH1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH1Q13686 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ALKBH1Q13686 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms