Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms