Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CDH18Q13634 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CDH18Q13634 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CDH18Q13634 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CDH18Q13634 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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