Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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