Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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TUBB3Q13509 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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TUBB3Q13509 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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TUBB3Q13509 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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TUBB3Q13509 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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TUBB3Q13509 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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TUBB3Q13509 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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TUBB3Q13509 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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TUBB3Q13509 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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TUBB3Q13509 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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