Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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LSAMPQ13449 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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LSAMPQ13449 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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LSAMPQ13449 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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LSAMPQ13449 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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LSAMPQ13449 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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LSAMPQ13449 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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LSAMPQ13449 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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LSAMPQ13449 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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