Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 LAMB1-203ENST00000393560 2806 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 STRADA-204ENST00000392950 2778 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 LINC02133-202ENST00000569726 2626 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 DNAJB12-204ENST00000461919 2369 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 WASF3-201ENST00000335327 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SLC16A7-203ENST00000547379 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 OTUD6B-201ENST00000285420 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AL162231.4-201ENST00000564224 3264 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 POM121L6P-201ENST00000441186 1826 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SLC8A3-207ENST00000528359 2840 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SLC8A3-210ENST00000534137 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 CSPG4P13-202ENST00000567704 4801 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AL713866.1-201ENST00000563320 3125 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 KIF28P-202ENST00000504864 3064 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms