Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SGCGQ13326 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SGCGQ13326 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SGCGQ13326 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SGCGQ13326 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SGCGQ13326 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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SGCGQ13326 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SGCGQ13326 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SGCGQ13326 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SGCGQ13326 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SGCGQ13326 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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