Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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