Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RLFQ13129 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RLFQ13129 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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