Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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