Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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BNIP1Q12981 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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BNIP1Q12981 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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BNIP1Q12981 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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BNIP1Q12981 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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BNIP1Q12981 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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