Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms