Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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PTPRJQ12913 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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