Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
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