Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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