Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 ITIH5-201ENST00000397145 3132 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 GRM4-209ENST00000609222 3176 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 CCDC148-201ENST00000283233 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms