Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms