Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms