Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FMODQ06828 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FMODQ06828 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FMODQ06828 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FMODQ06828 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FMODQ06828 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FMODQ06828 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FMODQ06828 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FMODQ06828 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.6 ms