Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms