Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms