Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CD164Q04900 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CD164Q04900 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms