Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms