Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN7AQ01118 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN7AQ01118 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms