Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms