Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms