Protein–RNA interactions for Protein: P81408

FAM189B, Protein FAM189B, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM189BP81408 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM189BP81408 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM189BP81408 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms