Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JAG1P78504 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JAG1P78504 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JAG1P78504 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JAG1P78504 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JAG1P78504 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JAG1P78504 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JAG1P78504 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JAG1P78504 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JAG1P78504 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JAG1P78504 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JAG1P78504 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JAG1P78504 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JAG1P78504 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JAG1P78504 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
JAG1P78504 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JAG1P78504 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 290.4 ms