Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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