Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms