Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL3P58215 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms