Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSCP56915 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.9 ms