Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CLDN15P56746 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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