Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms